图纸管理软件应该存档以下目录，以便于组织和管理工厂的图纸：

项目目录：

各个项目的设计图纸及相关文件。
产品目录：

按产品分类存储图纸，包含不同型号和版本。
部门目录：

设计、工艺、制造、质量等部门的专用图纸和文件。
版本目录：

各图纸的历史版本及变更记录。
材料目录：

图纸所需的材料规格和清单。
工艺目录：

加工工艺流程图及相关说明。
标准规范目录：

企业内部及行业标准的图纸和规范。
归档目录：

已完成项目或产品的图纸归档存储。
这样设置目录结构有助于高效管理和快速检索图纸，提高工作效率。

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